home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00353 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  28 lines
  1. **************************************
  2. * Staphylocoagulase repeat signature *
  3. **************************************
  4.  
  5. Staphylocoagulase [1,2] is  an  extracellular  protein  produced   by  several
  6. strains of Staphylococcus aureus and  which specifically forms a complex  with
  7. prothrombin. This  complex named staphylothrombin  can clot fibrinogen without
  8. any proteolytic cleavage of prothrombin.
  9.  
  10. The C-terminal of staphylocoagulase consists  in the tandem repeat of a domain
  11. of 27 amino acids.  There are from 6 to 8  of these repeats,  depending on the
  12. strain of Staphylococcus aureus.  The region  containing  these repeats is not
  13. required for the procoagulant activity.
  14.  
  15. We have  derived a signature  pattern specific  for  the 27 residues repeat of
  16. staphylocoagulase.
  17.  
  18. -Consensus pattern: A-R-P-x(3)-K-x-S-x-T-N-A-Y-N-V-T-T-x(2)-[DN]-G-x(3)-Y-G
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21. -Last update: November 1990 / First entry.
  22.  
  23. [ 1] Kaida S., Miyata T., Yoshizawa Y., Kawabata S., Morita T., Igarashi H.,
  24.      Iwanaga S.
  25.      J. Biochem. 102:1177-1186(1987).
  26. [ 2] Kaida S., Miyata T., Yoshizawa Y., Igarashi H., Iwanaga S.
  27.      Nucleic Acids Res. 17:8871-8871(1989).
  28.